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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

水利部：建立健全水土保持协调机制 发挥流域管理机构作用******

　　国务院新闻办公室于1月12日举行新闻发布会，介绍加强新时代水土保持工作有关情况。会上，水利部副部长朱程清介绍，水土保持是生态文明建设的必然要求。加强新时代水土保持工作，必须要坚持和加强党对水土保持工作的全面领导，加快构建党委领导、政府负责、部门协同、全社会共同参与的水土保持工作格局，推动各方面和全社会进一步统一思想、凝聚共识、落实责任、形成合力。

　　《关于加强新时代水土保持工作的意见》（以下简称《意见》）聚焦解决水土保持领域的体制性障碍、机制性梗阻、政策性创新问题，围绕加快构建水土保持工作格局，提出了一系列体制机制改革创新举措，主要是以下几个方面：一是在组织领导方面。《意见》强调要坚持和加强党对水土保持工作的全面领导，实行中央统筹、省负总责、市县乡抓落实的工作机制，实行地方政府水土保持目标责任制和考核奖惩制度。二是在统筹协调方面。《意见》明确提出国家层面要建立水土保持部际协调机制，水利部要发挥好牵头组织和统筹协调作用，相关部门要强化协同配合。三是投入机制方面。《意见》明确中央财政继续支持水土保持工作，地方各级政府要保障水土保持投入。

　　同时，《意见》还在协同监管、宣传引导等方面提出了一系列举措。通过这些机制建设，引导全社会进一步强化水土保持意识，加大水土保持力度。（记者 刘昊）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）